清政府的低效，给了周琅充足的时间，整个十月，十一月，周琅竟然都没等来清军的大规模进攻。
在浙江、江西和广东的清军，只是地方部队进行了小范围的调动，战斗力和兵力都不足以攻入福建。
周琅的軍队，则向北推进到了跟浙江交界的分水关，占领这个浙江进入福建的官道必经之地，基本上就掐断了大规模清军从浙江反攻福建的通道。
沿着闽江、建江推进道了福建西北的武夷山茶区崇安、南浦等县，切断浙江西南和江西东北进入福建的通道；沿着闽江、金溪进入了建宁、泰宁等县，切断江西中部进入福建的通道。以此建立起依托武夷山脉的第一道防线；沿着晋江抵达云山、沿着九龙江抵达玳瑁山，建立第二道防线。
至于汀江上游的汀州地区，由于无法通过入海河口上溯控制整条流域，暂时予以放弃，但在跟潮汕地区接壤的云霄一带，建立了防御基地。一旦广东地方軍队发动攻击，视情况出击，夺占潮汕地区，取得汀江（韩江）入海口，上溯汀州，控制整个福建境内。如果广东軍队观望，周琅不介意跟他们保持和平相处的默契。
两个多月时间，周琅建立了内外两条防线，控制了十几座关卡，布置了五百多门大炮。
同时沿着河流，建立通往这些关卡的交通线。
外部防御体系基本建成，但福建内部依然是一片混乱，周琅只能控制交通线和交通线附近州县，大半福建州县还在清军手里控制着，更不用说广大的乡村地区，根本就没有任何控制力，这是巨大的隐患，可他就是没有多余的兵力去加强控制。
不过盟友陈周全的北伐，在周琅的帮助下，也终于开始了。
陈周全已经今非昔比，在夺取了台湾府城，镇压了嘉义等县的地主武装反抗之后，陈周全在嘉义县、台湾县进行了大规模的清洗活动，旧地主阶层几乎被他给彻底消灭了，但一个新的地主阶层又出现了，因为陈周全打击地主，主要是出于报复心理，他痛恨这些地主武装站在清军一边跟他做对，所以他杀了地主之后，并没有把地主的土地分给佃农，他的认识还没有到这种高度，他将这些土地分给了跟随他的有功之臣，陈光辉这样的亲信，一个个都分到了上万亩甚至数万亩的良田。
另外陈周全还镇压了漳州和粤籍两大反对他的族群，将反对他的力量，从乡村基层进行了一场清洗。虽然杀人很多，可是永绝了后患。让他在将清军赶出台湾之后，对社会基层的控制力大大加强，结果当清军第二次反攻台
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