于城中十字路的东南区的角上，占地面积总共约有三千多平方米，分为衙门正堂，后宅和库房三个部份。临街也做成两层，未来衙门的一些办事机构，就安排在这里。其余的地方也西南和西北区的规化来划份，大致也可以分出三百多户来。
只有西南区不设居民住宅，将临街与千总衙门相对的一半区域全都留出来，做为平时连兵，集会，聚众或是临时组织各种活动的场地，也可以用来进行蹴鞠出赛。西南区的另一半安排的是各种工匠作坊和兵营。因为考虑到大部份士兵都会把家搬到城里来住，因此兵营的规模在一千五百人以内。
这样算下来，穆陵城里可以容纳一千一百多户，加上士兵，共计在五千人左右，差不多可以赶上一个小县城了。不过考虑到一定会有一些大户不止占用一间民宅的地方，因此商毅预计末来穆陵城的人口将在一千户以内,而且基本都以军队的家眷为主。
同时商毅还考虑,以后在穆陵城的南北各扩建出一个城来,将穆陵城的规模扩大一部以上,作为自己曰后的根据地,也就足够了。