再像过去那样从小当到老，然后由子孙世袭，而是改为从全国所有边军卫所军及“新军”中择优选拔，入选时年龄不能超过二十岁，最多服役两年，便会调出四卫。武骧二卫及腾骧左卫的千户，以及腾骧右卫的百户由皇帝直接任命，只服从于皇命，不听其他任何官员调遣，同样最多任职两年。
皇城之内即是皇帝家事，宿卫安排向由皇帝独断，群臣倒是没有插嘴的资格。当然也有脑筋转得快的大臣，对朱由检的安排不禁暗赞：此举既确保了宿卫军队完全掌握在皇帝一人手中，还提高了宿卫军的战斗力。更重要的是，两年一轮换制度，让宿卫军队来不及互相熟悉，“变生肘腋”这种事，就很难发生了！