被光绪帝特赐四品花翎，委任为辽阳总巡、通化总巡。
1913年10月24日，北洋政府授予他陆军少将衔。1914年2月，被授予陆军少将加中将衔；4月19日升陆军中将。
5月16日，马龙潭任东边镇守使。
1920年，被张作霖免去镇守使，改派担任洮昌道尹。1921年，辞去道尹，退出政界。
1922年，改任四洮铁路督办，监修四洮铁路郑洮段工程。
1924年，马龙潭等人发起募捐，修建梨树县第十五小学（今中央东路小学）校舍。
1931年，“九·一八事变”后，拒绝日本侵略者的任职。
马龙潭晚年担任四平街“红十字会”名誉会长、道德会会长和直鲁同乡会会长。1940年2月，病逝于四平寓所，享年84岁（虚岁）。1948年迁葬郊区房身沟屯。
马龙潭虽然身为旧中国的军阀、官僚地主，但他出身清贫，关心人民疾苦，兴办了许多公益事业。
他写得一手好字，尤擅行草，书法刚柔相济，潇洒流畅。
1900年7月沙皇俄国借口保护中东铁路及南满洲支线出兵东北，8月上旬俄国军队一部从旅顺口北犯，马龙潭率部前往阻击，连败俄军。
俄国军队占领奉天后，马龙潭奉命保护兴京（辽宁省新宾满族自治县）清朝皇帝祖陵有功，清德宗爱新觉罗·载湉特赏赐四品花翎顶戴。
1903年，被清朝招抚的忠义军首领张桂林随俄军驻通化，得到俄军军官袒护，放纵部下四处掳掠，激起民怨沸腾。
马龙潭决定除掉这一祸害，于是设计捕杀了张桂林。张桂林余部盘踞通化境内蜊蛄河负隅顽抗，图谋报复。
马龙潭冒险率先攀登悬崖，直插驻地，仿佛神兵天降一般，众贼个个心惊胆战，乖乖就擒，张桂林余部至此得到彻底清除。
然而由于清政府的腐败无能，这样一个大快人心的事情却被俄军当做借口，迫于压力，朝廷把马龙潭革职。
不久，清朝又重新起用马龙潭为奉天中路第2营马队统带（相当团长）。
1907年，按年龄为序，马龙潭、吴俊升、孙烈臣、张景惠、冯德麟、汤玉麟、张作霖、张作相8人结拜为盟兄弟。
1909年春马龙潭升任奉天右路巡防军帮统（相当于副旅长），驻军凤城。
1909年10月任统领（相当于旅长）。
1910年秋带兵镇
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